Sau năm 1975, Nội Thôn là một xã thuộc huyện Hà Quảng.

Đến năm 2019, xã Nội Thôn được chia thành 10 xóm: Cà Rẻ, Cả Tiểng, Làng Lỵ - Khản Sả, Lũng Chuống - Tểnh Po - Lũng Pụng, Lũng Rì, Lũng Rại, Pác Tụ - Ngườm Vài - Lũng Xuân, Rủ Rả, Pác Hoan, Lũng Mảo - Tiểng Lằm.

Ngày 9 tháng 9 năm 2019, sáp nhập xóm Cả Rẻ vào xóm Pác Hoan.[3]